林類

-亞熱帶雨林（海拔600~1800m）
大葉楠、香楠、赤校、青剛櫟、菱果柯、柃木、山茶、雞屎樹。蕨類、蘭科、蔓莖植物亦很普遍。

-暖溫帶雨林（海拔1800~2300m）
台灣禦楊、巒大八角、雲葉、假皂莢、王山假沙梨、巒大花楸、台灣華山松、台灣二葉杉、台灣黃杉、台灣鐵杉。 　　　　　

蕨類

-樹蕨、樹幹蕨、地生蕨、岩生蕨、水生蕨、蔓性蕨 　

水生植物-

-挺水植物　
水蕨、南國田字草、三白草、過江龍、水丁香、水苦賈、野慈菇、鴨舌草、蘆葦、卡開蘆、菰

-沈水植物　
金魚藻、黑藻、馬藻

-飄浮植物　
滿江紅、布袋蓮、大萍、水萍、槐葉類

海濱植物-

水筆仔、馬鞍藤、白花牽牛、濱刀豆、無根草、大年艾、大蟛蜞菊、文殊蘭、濱刺草、海埔姜、水黃皮、南嶺蕘花、黃種、馬甲子、林投、木麻黃

鳥類-

-針闊葉林混生區（海拔1000~2800m）
小卷尾、紅山椒鳥、棕面鶯、繡眼畫眉、紅尾鶲、巨嘴鴉、青背山雀 　　　　　　　　

-闊葉林區(海拔800~1800m)
黑枕藍鶲、山紅頭、小啄木、五色鳥 　　　　　　　　

-丘陵區(海拔200~800m)
白環嘴鵯、紅嘴黑鵯、斑鵛鳩、白頭翁、綠繡眼、紅鳩、樹竹雞、紫嘯鶇、筒鳥 　　　　　　　　

-平地(中港溪中下游平原地)
白頭翁、大卷尾、白腰文鳥、黃頭鷺、灰頭鷦鶯 　　　　　　　　

-海岸混地(溪口朝間帶及海灘地)
小白鷺、黃頭鷺、夜鷺

兩棲類

盤古蟾蜍、黑眶蟾蜍、中國蟾蜍、貢德氏赤蛙、古氏赤蛙、拉都希氏赤蛙、澤蛙、長腳赤蛙、虎皮蛙、梭德氏赤蛙、前斯文豪氏赤蛙、日本樹蛙、楬樹蛙、艾氏樹蛙、面天樹蛙、白頜樹蛙、台北樹蛙、小雨蛙共十八種

爬蟲類

-蜥蝪類　
斯文豪氏攀蜥、黃口攀蜥、台灣草蜥、蓬萊草蜥、麗紋石龍子、中國石龍子、印度蜥蝪、台灣滑蜥　 　　　　

-蛇類　
雨傘節、眼鏡蛇、龜殼花、赤尼青竹絲、花浪蛇、青蛇、臭青公、過山刀、錦蛇 　　　　　　　　　

-龜類　
鱉、斑龜