鳥類

根據記錄多達98種，其中不乏特有或稀有鳥種。尤其奇美至長虹橋段，沿途風景秀麗，是健行賞鳥的好地方。

植物

溪谷沿岸的砂地上有耐旱的草本植物，河岸邊到中低海拔間的坡地上有各種的熱帶植物相，中高海拔的山區則有亞熱帶雨林。海囗獅球嶼更有保存良好的典型荊棘林。

地形

斷層、曲流發育完整，德武河階，與舞鶴河階相對。

地質

港口層砂頁岩交互排列瑞港公路西段沿途可見大港口層剖面，頁岩、砂岩互層，井然有序有如超大型的千層派，十分有趣。秀姑漱玉過去秀姑巒溪下游段河床中曾滿布晶瑩潔白的石灰石，如今漱玉美景因不法商人濫採石灰時而使景觀大為失色。