鳥類

大甲溪流域的鳥類多達百餘種，近年常見的有七十多種，因習性的差異，活動在棲息地的鳥類也不同，有鴛鴦、朱雀、巨嘴鴉、紅頭山雀、深山竹雞.....

植物

由於海拔高低直接影響植物的分佈，因此，大甲溪中上游兩岸的高山區，長有許多珍貴的原生植群，如肖楠、楓香、台灣紅豆杉、台灣五葉松等數十種，即使下游的出海口也有珍稀的紅樹林、雲林莞草、大安水簑衣等國寶級水生植物。